motiejus
/
turbonss
1
Fork 0
Code Releases Activity
turbonss/cxxmph/mphtable.h

300 lines
17 KiB
C++
Raw Blame History

template <class Key>
class MPHTable {
public:
typedef Key key_type;
MPHTable(cmph_t* mphf);
~MPHTable();
template <class Iterator>
bool reset(Iterator begin, Iterator end);
cmph_uint32 index(const key_type& x) const;
private:
MPHTable();
cmph_t* mphf;
// Generates three hash values for k in a single pass.
static hash_vector(cmph_uint32 seed, const char* k, cmph_uint32 keylen, cmph_uint32* hashes) ;
};
unsigned int MPHTable::index(const key_type& key) const {
cmph_uint32 keylen = sizeof(key);
chd_ph_data_t* chd = reinterpret_cast<chd_ph_data_t*>(mphf->data);
cmph_uint32 hl[3];
cmph_uint32 dispatch, position;
cmph_uint32 probe0, probe1;
cmph_uint32 f,g,h;
hash_vector(chd_ph->hl, reinterpret_cast<const char*>(&key), keylen, hl);
g = hl[0] % chd_ph->nbuckets;
f = hl[1] % chd_ph->n;
g = hl[2] % (chd_ph->n - 1) + 1;
dispatch = compressed_seq_query(chd_ph->cs, g);
probe0_num = disp % chd_ph->n;
probe1_num = disp / chd_ph->n;
position = (cmph_uint32)((f + ((cmph_uint64)h)*probe0 + probe1) % chd_ph->n);
return position;
}
void MPHTable::hash_vector(cmph_uint32 seed, const char* k, cmph_uint32 keylen,
cmph_uint32* hashes) {
cmph_uint32 len = keylen, length = keylen;
hashes[0] = hashes[1] = 0x9e3779b9; // the golden ratio; an arbitrary value
hashes[2] = seed; // the previous hash value - seed in our case
// consume most of the key
while (len >= 12) {
hashes[0] += ((cmph_uint32)k[0] +((cmph_uint32)k[1]<<8) +((cmph_uint32)k[2]<<16) +((cmph_uint32)k[3]<<24));
hashes[1] += ((cmph_uint32)k[4] +((cmph_uint32)k[5]<<8) +((cmph_uint32)k[6]<<16) +((cmph_uint32)k[7]<<24));
hashes[2] += ((cmph_uint32)k[8] +((cmph_uint32)k[9]<<8) +((cmph_uint32)k[10]<<16)+((cmph_uint32)k[11]<<24));
mix(hashes[0],hashes[1],hashes[2]);
k += 12; len -= 12;
}
// Consumes the remaining 11 bytes
hashes[2] += length;
switch(len) { // all the case statements fall through
case 11:
hashes[2] +=((cmph_uint32)k[10]<<24);
case 10:
hashes[2] +=((cmph_uint32)k[9]<<16);
case 9:
hashes[2] +=((cmph_uint32)k[8]<<8);
/* the first byte of hashes[2] is reserved for the length */
case 8:
hashes[1] +=((cmph_uint32)k[7]<<24);
case 7:
hashes[1] +=((cmph_uint32)k[6]<<16);
case 6:
hashes[1] +=((cmph_uint32)k[5]<<8);
case 5:
hashes[1] +=(cmph_uint8) k[4];
case 4:
hashes[0] +=((cmph_uint32)k[3]<<24);
case 3:
hashes[0] +=((cmph_uint32)k[2]<<16);
case 2:
hashes[0] +=((cmph_uint32)k[1]<<8);
case 1:
hashes[0] +=(cmph_uint8)k[0];
/* case 0: nothing left to add */
}
mix(hashes[0],hashes[1],hashes[2]);
}
cmph_uint32 MPHTable::select_query(select_t* sel, cmph_uint32 one_idx) {
cmph_uint8* bits_table = sel->bits_vec;
cmph_uint32* select_table = sel->select_table;
cmph_uint32 vec_bit_idx, vec_byte_idx;
cmph_uint32 part_sum, old_part_sum;
vec_bit_idx = select_table[one_idx >> NBITS_STEP_SELECT_TABLE]; // one_idx >> NBITS_STEP_SELECT_TABLE = one_idx/STEP_SELECT_TABLE
vec_byte_idx = vec_bit_idx >> 3; // vec_bit_idx / 8
one_idx &= MASK_STEP_SELECT_TABLE; // one_idx %= STEP_SELECT_TABLE == one_idx &= MASK_STEP_SELECT_TABLE
one_idx += rank_lookup_table[bits_table[vec_byte_idx] & ((1 << (vec_bit_idx & 0x7)) - 1)];
part_sum = 0;
do {
old_part_sum = part_sum;
part_sum += rank_lookup_table[bits_table[vec_byte_idx]];
vec_byte_idx++;
} while (part_sum <= one_idx);
return select_lookup_table[bits_table[vec_byte_idx - 1]][one_idx - old_part_sum] + ((vec_byte_idx-1) << 3);
}
/*
rank_lookup_table[i] simply gives the number of bits set to one in the byte of value i.
For example if i = 01010101 in binary then we have :
rank_lookup_table[i] = 4
*/
static cmph_uint8 rank_lookup_table[256] ={
0 , 1 , 1 , 2 , 1 , 2 , 2 , 3 , 1 , 2 , 2 , 3 , 2 , 3 , 3 , 4
, 1 , 2 , 2 , 3 , 2 , 3 , 3 , 4 , 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5
, 1 , 2 , 2 , 3 , 2 , 3 , 3 , 4 , 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 1 , 2 , 2 , 3 , 2 , 3 , 3 , 4 , 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6 , 4 , 5 , 5 , 6 , 5 , 6 , 6 , 7
, 1 , 2 , 2 , 3 , 2 , 3 , 3 , 4 , 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6 , 4 , 5 , 5 , 6 , 5 , 6 , 6 , 7
, 2 , 3 , 3 , 4 , 3 , 4 , 4 , 5 , 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6
, 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6 , 4 , 5 , 5 , 6 , 5 , 6 , 6 , 7
, 3 , 4 , 4 , 5 , 4 , 5 , 5 , 6 , 4 , 5 , 5 , 6 , 5 , 6 , 6 , 7
, 4 , 5 , 5 , 6 , 5 , 6 , 6 , 7 , 5 , 6 , 6 , 7 , 6 , 7 , 7 , 8
};
/*
select_lookup_table[i][j] simply gives the index of the j'th bit set to one in the byte of value i.
For example if i=01010101 in binary then we have :
select_lookup_table[i][0] = 0, the first bit set to one is at position 0
select_lookup_table[i][1] = 2, the second bit set to one is at position 2
select_lookup_table[i][2] = 4, the third bit set to one is at position 4
select_lookup_table[i][3] = 6, the fourth bit set to one is at position 6
select_lookup_table[i][4] = 255, there is no more than 4 bits set to one in i, so we return escape value 255.
*/
static cmph_uint8 select_lookup_table[256][8]={
{ 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 5 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 255 , 255 } ,
{ 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 6 , 255 , 255 } ,
{ 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 5 , 6 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 255 } ,
{ 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 5 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 7 , 255 } ,
{ 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 6 , 7 , 255 } ,
{ 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 5 , 6 , 7 , 255 } ,
{ 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 } ,
{ 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 , 255 } , { 0 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } ,
{ 1 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 1 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 } ,
{ 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 , 255 } , { 0 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 } ,
{ 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 255 } , { 0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 } };
cmph_uint32 MPHTable::compressed_seq_query(compressed_seq_t * cs, cmph_uint32 idx)
{
cmph_uint32 enc_idx, enc_length;
cmph_uint32 rems_mask;
cmph_uint32 stored_value;
cmph_uint32 sel_res;
assert(idx < cs->n); // FABIANO ADDED
rems_mask = (1U << cs->rem_r) - 1U;
if(idx == 0) {
enc_idx = 0;
sel_res = select_query(&cs->sel, idx);
} else {
sel_res = select_query(&cs->sel, idx - 1);
enc_idx = (sel_res - (idx - 1)) << cs->rem_r;
enc_idx += get_bits_value(cs->length_rems, idx-1, cs->rem_r, rems_mask);
sel_res = select_next_query(&cs->sel, sel_res);
};
enc_length = (sel_res - idx) << cs->rem_r;
enc_length += get_bits_value(cs->length_rems, idx, cs->rem_r, rems_mask);
enc_length -= enc_idx;
if(enc_length == 0) return 0;
stored_value = get_bits_at_pos(cs->store_table, enc_idx, enc_length);
return stored_value + ((1U << enc_length) - 1U);
};
View Git Blame Copy Permalink